近期發表在《自然·通訊》上的一項研究:科學家首次證實,古人類的DNA能夠在洞穴巖壁上保存數千年。
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該研究隸屬于第一藝術多學科研究項目,項目原本的核心目標是對巖畫顏料開展年代測定與化學分析,DNA研究是其中的配套拓展方向。
研究團隊走遍伊比利亞半島的11座史前洞穴,從西班牙的阿爾塔米拉、馬爾特拉維索到葡萄牙的埃斯庫拉爾,一共選取24處巖畫面板開展采樣。
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采樣的巖畫多以紅赭石繪制,以線條、圓點等抽象符號為主,同時也涵蓋了馬爾特拉維索洞穴的手印模板、阿爾塔米拉洞穴的具象壁畫等不同類型,覆蓋舊石器時代巖畫的多種表現形式。
為盡可能保護珍貴的巖畫,采樣過程格外謹慎。
大部分樣本用無菌手術刀輕輕刮取極少量的顏料與方解石碎屑,部分站點采用牙科鉆、無菌拭子取樣,或是收集自然脫落、隨滴水掉落的顏料碎片;對空白巖壁的對照樣本,也會先用圖像增強技術確認無顏料痕跡后再取樣。
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除了巖壁,他們還采集了洞穴地面沉積物,包括疑似古人研磨顏料的區域,甚至還有一根來自阿爾塔米拉洞穴、內壁沾有紅赭石的鳥骨:考古學家推測,這根骨頭曾被當作噴槍,古人通過它將顏料吹到巖壁上。
在分析巖壁樣本之前,研究團隊先檢測了洞穴沉積物的DNA,以此判斷整個洞穴的基因保存條件。
結果令人驚喜:多個洞穴的地層中都找到了豐富的史前哺乳動物DNA,在萊斯佩德羅塞斯洞穴里,甚至出現了抹香鯨的基因痕跡。
這印證了考古學界的猜想:當時的伊比利亞狩獵采集者已經懂得捕獵海洋哺乳動物,海洋資源是他們食譜的重要組成部分。
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但令研究人員意外的是,沉積物中竟保存著古人類的線粒體DNA,尤其是科瓦隆洞穴的沉積物樣本保存質量格外出色,含量最高的一份樣本能測出近兩萬七千條獨特的人類線粒體DNA片段,現代人類污染占比僅0.1%,說明這些洞穴的環境非常適合DNA留存。
真正的發現來自巖壁樣本。
在包含分樣的上百份巖壁樣本中,研究團隊一共在5份原始樣本里找到了可信的古人類DNA:其中1份來自埃斯庫拉爾洞穴帶顏料的方解石殼層,另外4份都來自巖畫附近的空白巖壁。
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而更關鍵的是,這5份樣本呈現出兩種截然不同的沉積特征。
有兩份樣本(一份帶顏料、一份空白)只檢測出人類DNA,完全沒有其他哺乳動物的基因。
洞穴地面沉積物中如果存在人類DNA,通常都會伴隨大量動物DNA的痕跡;如果DNA是被泥土或滲水帶到巖壁上的,大概率也會攜帶動物基因。
因此研究人員判斷,這兩份僅含人類DNA的樣本,更可能是古人直接接觸巖壁留下的:可能是作畫時手扶過巖壁,可能是吹顏料時濺上的唾液,也可能是汗水等體液,這些直接接觸,把人類的基因牢牢鎖在了礦物表面。
剩下的3份樣本則同時含有人類和動物DNA,更可能是間接沉積的結果:比如古人踩過地面泥土后又觸摸巖壁,或是洞穴滲水把地層中的DNA帶到了墻壁上。
雖然樣本量有限,但這些DNA已經能傳遞不少信息。
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科瓦隆洞穴兩份空白巖壁上的DNA,聚類在西方狩獵采集者的遺傳變異范圍內,和已知的維拉布羅納、奧伯卡塞爾古人群體遺傳特征接近,線粒體單倍群也屬于歐洲狩獵采集者中最常見的U5a’b亞型。
通過性染色體的覆蓋比例,研究人員還能判斷:三份混有動物DNA的巖壁樣本,DNA都主要來自女性;而埃斯庫拉爾洞穴那份僅含人類DNA的空白樣本,則更可能來自男性。
埃斯庫拉爾的帶顏料樣本因DNA數據量不足,無法完成人群歸屬和性別判斷。
關于這些DNA的年代,研究團隊通過DNA的特征性脫氨基損傷進行了估算——古DNA會隨時間推移出現末端堿基損傷,就像基因的歲月印記。
結合洞穴考古背景判斷:埃斯庫拉爾洞穴在距今四五千年的銅石并用時代就被完全封存,直到1963年才因采石重新打開,因此巖壁上的DNA至少有四五千年歷史,甚至可能追溯到更久遠的舊石器時代晚期。
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科瓦隆洞穴巖壁DNA的損傷程度,和當地馬格德林文化(距今約1.45萬到1.15萬年)地層沉積物的DNA大致相近,不排除來自同一時期的可能,但僅通過損傷程度只能確定最小年齡,無法精確認定年代。
但這絲毫不影響這項發現的分量。
它第一次證明,洞穴巖壁本身就是一座史前人類的基因檔案館,哪怕是沒有巖畫的普通洞穴,也可能通過巖壁上的DNA,還原出曾經在此活動的人群、他們的性別,甚至在洞穴里的活動范圍,不用大規模挖掘地層,只需要刮取極少量巖壁粉末,就能獲得珍貴的遺傳信息。
幾萬年前,人類在黑暗洞穴里用火光照亮巖壁,留下屬于自己的印記。
今天,我們用最精密的技術,從那些幾乎看不見的痕跡里,重新讀懂他們的存在。
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