今天想和大家聊一個非常有意思的抗病毒研究方向 ——缺陷病毒基因組(Defective Viral Genomes, DVGs)。
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你可能會好奇:"缺陷" 的病毒,怎么還能用來做 "防御" 呢?這聽起來有點反直覺。但正是這種 "不完整" 的病毒基因組,正在成為抗病毒領域的一匹黑馬。
最近發表在《Microbiology and Molecular Biology Reviews》上的一篇重磅綜述,系統梳理了 DVGs 作為新型抗病毒策略的潛力與挑戰。今天我們就來深入聊聊這個話題。
一、什么是缺陷病毒基因組?1.1 基本概念
病毒在復制過程中,由于聚合酶的低保真性,經常會產生一些缺失了關鍵基因的亞基因組 RNA 片段,這就是缺陷病毒基因組(DVGs)。
簡單來說:
DVG 本身不能獨立復制—— 它缺少必需的編碼基因
但它能 "蹭" 完整病毒的資源—— 在共感染時,利用完整病毒提供的聚合酶等蛋白進行復制
被衣殼包裹后叫 DIP—— 缺陷干擾顆粒(Defective Interfering Particles),也叫治療性干擾顆粒(TIPs)
圖1:內部缺失型 DVG(id-DVG)的形成機制1.2 兩種主要類型
① 內部缺失型(id-DVGs)
最常見,正鏈和負鏈 RNA 病毒都能產生
保留 5' 和 3' 端的復制必需元件,中間大片段缺失
形成機制:模板轉換(copy-choice)或環出模型(looping-out)
代表病毒:登革熱、寨卡、新冠、甲流
② 回折型(cb-DVGs)
主要見于負鏈非節段 RNA 病毒(如 RSV、埃博拉、狂犬病毒)
聚合酶中途解離,重新起始于新生鏈,形成反向互補序列
復制效率極高,但幾乎不產生病毒 mRNA
圖2:回折型 DVG(cb-DVG)的形成與復制機制二、三重抗病毒機制:競爭 + 免疫 + 蛋白干擾
DVGs 之所以被看好,是因為它不是單一機制在起作用,而是三重打擊:
2.1 競爭性抑制 ——"分子寄生蟲" 策略
這是最經典的機制。DVGs 就像病毒細胞里的 "寄生蟲":
搶聚合酶:更短的基因組復制更快,積累速度是完整基因組的數倍
搶包裝位:優先被包裝進新的病毒顆粒
搶資源:爭奪核苷酸、核衣殼蛋白等
舉個例子:仙臺病毒的 cb-DVGs 積累速度是完整基因組的4 倍;登革熱患者血清中的 id-DVGs 可以小到只有全長基因組的2%。
2.2 先天免疫激活 ——"免疫佐劑" 效應
這是近年來的重大發現。DVGs 本身就是強效的先天免疫激動劑:
激活RIG-I/MDA5等模式識別受體
誘導I/III 型干擾素和大量抗病毒基因表達
效果比完整病毒更強、更快
為什么 DVGs 免疫原性更強?
暴露的 5' 三磷酸末端
特殊的雙鏈 RNA 結構
缺少病毒編碼的干擾素拮抗蛋白(如 NS1)
過去認為 DVGs 基本不編碼蛋白,但最新研究顛覆了這一認知:
甲流 PB2 片段的 id-DVG 產生PB2Δ 蛋白,直接結合 MAVS 激活干擾素
深度測序發現數百種隱性病毒肽,很多作為顯性負效應抑制劑
圖3:標準病毒、DVG/DIP 與宿主細胞的三方相互作用三、臨床前研究:六大代表性案例3.1 登革熱病毒 DI290
Harrich 團隊(本文通訊作者團隊)的工作:
建立了無感染性病毒污染的 DIP 規模化生產平臺
體外廣譜抗登革熱、寨卡、新冠
LNP 遞送DI290 RNA 到小鼠體內,強烈抑制登革熱復制
機制:主要通過干擾素通路
Weinberger 團隊的研究非常亮眼:
設計了 TIP1 和 TIP2 兩種 id-DVG,R?>1(可持續復制)
單次鼻內給藥,肺病毒載量降低 100 倍
既有預防效果(感染前 6 小時),也有治療效果(感染后 18 小時)
還能減少鼻腔排毒,保護同居的健康倉鼠
在免疫缺陷小鼠中顯著降低病毒血癥
能擴散到遠端器官(腦、卵巢),提示可預防神經并發癥和垂直傳播
還能在蚊子體內抑制病毒傳播
機制:純競爭抑制,不依賴先天免疫
刪除衣殼編碼區,保留復制酶,能自我復制
廣譜抗多種 RNA 病毒:腸道病毒、甲流、新冠
LNP 或 DIP 形式遞送均有效
新冠感染小鼠中,可調節免疫細胞招募,減輕炎癥
這是最具想象力的應用:
數學模型預測:TIPs 復制速度超過 HIV 3 倍以上就能 "跑贏" 病毒
最新實驗:改造后的 HIV TIP 在人源化小鼠中顯著降低病毒載量
恒河猴實驗:SHIV 病毒載量降低 3-5 個 log,30 周不發病
可在 ART 停藥后重新激活,抑制病毒反彈
在蚊子體內也能發揮作用,阻斷傳播鏈
表 1:不同病毒 DVG 及其抗病毒效應匯總四、四大挑戰與優化方向
當然,DVG 從實驗室走向臨床,還有不少坎要過:
4.1 設計優化:找到 "最佳平衡點"
不是越短越好 —— 需要在三個維度平衡:
復制速度(越短越快)
包裝效率(有些病毒偏好更長的 DVG)
免疫原性(結構特征影響 PRR 識別)
多項研究一致表明:
感染前或感染早期給藥效果最好
感染 48 小時后給藥效果明顯下降
高復制適應性的 DVG(R?>1)可能只需單次給藥
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4.4 免疫平衡:抗病毒 vs 炎癥風險
這是一把雙刃劍:
適度的干擾素激活 = 抗病毒保護
過度激活 = 細胞因子風暴、組織損傷
關鍵在于劑量、時程、細胞因子譜的調控
DVGs 與病毒持續感染的關系很微妙:
有研究認為 DVGs 通過激活 TNF 信號,選擇性清除高感染細胞,保留低水平感染細胞,促進持續感染
也有證據顯示 DVGs 只是長期復制的副產品
因果關系目前還不明確,需要更多研究
這直接關系到 DVG 治療的安全性 —— 如果用于急性感染,會不會反而造成慢性化?這是臨床轉化必須回答的問題。
總結與展望核心亮點
雙重/三重作用機制—— 直接競爭 + 免疫激活 + 蛋白干擾,病毒很難產生耐藥性
廣譜性—— 一種 DVG 可能對抗多種 RNA 病毒
自我擴增—— 單次給藥可能實現持續抑制
遞送技術成熟——LNP 等平臺已在 mRNA 疫苗中驗證
優化 DVG 設計,提高復制適應性和靶向性
開發組織特異性遞送系統
深入研究免疫平衡和炎癥風險控制
明確 DVG 與持續感染的關系
推進 I 期臨床試驗
說實話,DVG 這個方向讓我很興奮。它不像傳統抗病毒藥物那樣 "一個靶點一個藥",而是利用病毒本身的 "bug" 來對抗病毒,思路非常巧妙。特別是新冠 TIPs 和 HIV TIPs 的研究數據,讓人看到了真正的臨床潛力。
當然,現在還處于臨床前階段,距離真正成藥還有很長的路要走。但考慮到 RNA 病毒層出不窮的公共衛生威脅,這種廣譜、低耐藥、可自我擴增的抗病毒策略,值得我們持續關注。
參考文獻:Li D, Lin MH, Hao H, Zhou P, Maniam P, Harrich D. Turning defects into defenses: the potential and challenges of defective viral genome-based antiviral strategies. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 2026. doi: 10.1128/mmbr.00090-25
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